漳州市档案馆是保管市直党政机关、人民团体、部分企事业单位各种门类、载体档案资料的国家综合性档案馆。馆藏共138个全宗，68611卷，主要有民国档案、中华人民共和国成立后档案。这些档案来源于现有和已经撤销的市直机关、团体、企事业单位和其他组织，以接收、征集等方式进馆，属国家所有。根据档案内容和载体分为文书档案、科技档案、专门档案、重大活动档案、声像档案。

民国时期档案计540卷，分为2个全宗，还有照片档案314张。这些档案资料主要来源于民国政府福建省第五区行政督察专员公署和国民党龙溪县党部，内容包括党务、政务、水利、交通、邮电、金融税收、文教卫生等。

中华人民共和国时期档案共136个全宗，68071卷，时间为1949——1992年，部分全宗至2010年，来源于市直党政机关、人民团体、企事业单位、撤销机构的档案，集中反映了新中国成立后我市各个历史时期政治、经济、军事、文化、科技、教育、卫生等的历史面貌。各类档案的内容如下：

文书档案，是馆藏档案的主体和核心，这部分档案内容相当丰富、完整，是新中国成立以来漳州经济建设和社会发展的历史记录。主要反映市直各部门、各单位在新中国成立后各个历史时期进行社会主义革命和政治、经济、文化建设的情况，记载了这些单位的历史和主要职能活动。

科技档案主要有林业科技档案、漳州战备大桥、九龙江堤防工程等基本设施建设档案和龙溪机器厂、漳州罐头、漳州制药厂、漳州香料厂等厂矿基本建设档案、援建四川省彭州市项目建设档案。

涉外婚姻档案主要有我市公民与港、澳、台地区公民以及世界各地华人结婚登记档案。

会计档案主要有市二轻局、市纺织厂、市内燃机厂等机构撤销单位、破产企业的会计报表、账簿、凭证等档案。

人事档案主要为市级部分单位死亡干部的档案。

案件档案主要为市纪委、监察局查处违规、违纪干部形成的档案。

重大事件、重大灾害、重大活动档案主要有东山保卫战、漳州“六.九”百年罕见台风、洪水灾害、龙海榜山风格、漳州.中国水仙花节、红军攻克漳州六十周年纪念大会、澳大利亚总理霍克参加漳州国际毛纺有限公司揭幕典礼、菲律宾总统科.阿基诺夫人访问龙海角美鸿渐村、漳州首届中华灯谜艺术节、漳州花博会等档案。

声像档案主要有市首批农村社教活动纪实、市委领导同志在档案工作会上的录音、录像及纪念活动、庆典活动光盘等。

照片档案主要有民国档案照片；修建鹰厦铁路、中央和省领导视察漳州、中国女排在漳集训、纪念红军攻克漳州60周年活动、花博会、芗剧团赴新演出，举办漳州灯谜艺术节等。